A Secretaria da Saúde atua em desenvolver as atividades relacionadas com o Sistema Único de Saúde, especialmente saúde pública e medicina preventiva, atividades médicas, para-médicas odontológicas e sanitárias, educação para a saúde, administração hospitalar e ambulatorial, vigilância sanitária, vigilância epidemiológica, saneamento básico e atividades de meio ambiente relacionados com a sua área de atuação,pesquisa, produção e distribuição de medicamentos básicos,formulação de políticas de saúde, vigilância laboratorial. Neste andar também funciona o programa contra o tabagismo.